מטוס נוסעים לובי מדגם בואינג-727, שהיה בטיסה שגרתית מבנגאזי שבלוב לקהיר, טעה בניווט, סטה ממסלולו, חצה את תעלת סואץ וחדר לעומק סיני. מגדל הפיקוח בקהיר לא הזהיר את הקברניט ולא יידע אותו כי חצה את הגבול. שני מטוסי פאנטום מטייסת "האחת" הוזנקו לקראת המטוס ואותתו לטייס לנחות בשדה התעופה של רפידים. הטייס לא נשמע להוראות, התעלם מיריות האזהרה שנורו לעברו והמשיך בטיסה.

על-מנת לאלץ את המטוס לנחות, נורתה אש לעבר שורש הכנף. הקברניט הלובי ניסה לבצע נחיתת אונס, אך הדבר לא עלה בידו ומטוסו התרסק ועלה באש. בהתרסקות נהרגו 105 נוסעים ושבעה ניצלו.

ממצאי "הקופסה השחורה" הראו לאחר האירוע, כי הטייס סבר שהמטוסים הם מיגים מצריים וניסה לחמוק מהם. הרמטכ"ל דוד אלעזר, שנתן את ההוראה לפתוח באש, אמר אחרי האסון כי הוראתו לירות היתה מן ההחלטות הקשות שקיבל בחייו. שר הביטחון, משה דיין, קבע שבאותן נסיבות היתה ההחלטה נכונה, כיוון שהתקבלו התראות מודיעיניות רבות על כוונה לחטוף מטוס ולהתרסק איתו בפיגוע התאבדות בשמי תל-אביב. למרות קביעת הממשלה שהאשם היחיד באסון הוא קברניט המטוס הלובי, הוחלט לשלם פיצויים למשפחות ההרוגים.